Обязательно записать, чтоб потом не искал в следующий раз) Для того, чтобы выбрать нужный checkbox или radio пункт — используем:

$("#option").attr("checked", "checked");

где option — id нашего чекбокса

Для того, чтоб очистить выбор используем:

$("#option").removeAttr("checked");

Как всегда jQuery поражает своей простой и понятностью!